Zeman po svém zvolení uvedl, že nebude vyhlašovat amnestii a že nebude udělovat milosti, s výjimkou případů nevyléčitelně nemocných. Následně agendu žádostí o milost přesunul na ministerstvo spravedlnosti.

V jednotlivých případech nevyléčitelně nemocných si Zeman ponechal právo milost udělit.

Ministerstvo spravedlnosti koncem listopadu od prezidentské kanceláře žádosti o milost převzalo, a jak uvedla ministryně Benešová, nejprve přistoupilo k jejich selekci a vyhodnocení.