Hlavní obsah

Vědce propojí, výzkum urychlí. Studenti zapojili AI do boje s rakovinou

Jak dát „na frak“ rakovině co nejefektivnějším postupem při výzkumu její léčby, ukázal pomocí umělé inteligence (AI) čtyřčlenný tým studentů z pražských univerzit. Jejich AI nástroj zvaný OncoMatch dokáže na základě vědeckého záměru vyhledat a doporučit nejvhodnější odborníky, technologie i výzkumná pracoviště. Studenti tak bodovali na akci Rakathon, která je největším AI hackathonem zaměřeným na boj proti rakovině na světě.

Foto: NÚVR

Tým studentů z českých univerzit, který vyvinul nástroj OncoMatch pro výzkum rakoviny pomocí AI.

Článek

AI hackathon je týmová akce, ve které účastníci během omezeného času (od několika hodin po víkend) využívají nástroje umělé inteligence k vytváření nápadů, prototypů nebo řešení konkrétních problémů.

Jedním ze zadavatelů výzev na hackathonu, který se konal v polovině října současně v Praze, Brně a Ostravě, byl Národní ústav pro výzkum rakoviny (NÚVR). Ten účastníky postavil před úkol vytvořit inteligentní nástroj usnadňující spolupráci mezi výzkumnými pracovišti.

Vítězem této výzvy se stal čtyřčlenný tým studentů, který si říká „dudes“, ve složení Zakhar Li (VŠE v Praze), Nikita Garbovskii (VŠFS), Daniil Khmelnytskyi a Daniil Sandakov (oba ČVUT v Praze). Zadařilo se natolik, že NÚVR nyní plánuje s jeho autory pokračovat ve vývoji a ověřit možnosti využití nástroje v reálné výzkumné praxi.

Rozlišuje podrobnosti

„Tuto výzvu jsme si vybrali proto, že jako jedna z mála letos nabízela příležitost přímo pomoci vědcům,“ vysvětluje oceněný tým a dodává: „Ze své zkušenosti víme, jak je někdy těžké najít k sobě do týmu někoho, koho právě nutně potřebujeme. Naše řešení je zatím ve stadiu pilotu, jsou v něm data o výzkumných skupinách NÚVR, ale je škálovatelné a dá se poměrně snadno rozšířit na vědeckou komunitu po celém světě.“

Jejich projekt OncoMatch funguje na jednoduchém principu: výzkumník zadá svou vědeckou hypotézu nebo záměr a systém mu doporučí odborníky, kteří mají potřebné zkušenosti, znalosti či přístup k odpovídajícím technologiím.

Na rozdíl od běžného internetového vyhledávání přitom OncoMatch nehledá pouze shodu klíčových slov. Analyzuje vědecké publikace a informace o skutečném zapojení jednotlivých výzkumníků do studií.

„Dokáže tak například rozlišit, kdo se podílel na návrhu výzkumu, kdo prováděl laboratorní analýzy nebo kdo zajišťoval biologické vzorky. U každého doporučení zároveň uvádí konkrétní vědecké publikace, o které svůj výběr opírá,“ dodali členové vítězného týmu.

Nové možnosti léčby nádoru mozku

Fungování si lze představit na příkladu vědce, který chce zkoumat nové možnosti léčby nádoru mozku. Pro svůj projekt potřebuje odborníka na nádorovou biologii, pracoviště disponující specifickou laboratorní technologií a klinického partnera z oboru. „Namísto zdlouhavého hledání jednotlivých institucí mu OncoMatch může nabídnout návrh týmu, vysvětlit přínos i potenciál jednotlivých partnerů a upozornit i na případné chybějící odbornosti či metodické přístupy,“ popsali autoři.

Při vývoji využili veřejně dostupné informace o téměř dvou tisících výzkumnicích a výzkumnících a více než 4 600 vědeckých publikacích. Do systému zahrnuli také údaje o klinických studiích, výzkumných infrastrukturách a biobankách. Nástroj nepracuje s osobními zdravotními údaji pacientů.

„Chtěli jsme vytvořit nástroj, který vědcům nejen doporučí technologické potřeby a vhodné spolupracovníky, ale také dokáže vysvětlit, proč právě oni mohou být pro daný projekt přínosem. Důležité pro nás bylo, aby každé doporučení vycházelo z ověřitelných informací, nikoli pouze z odpovědi generované umělou inteligencí. Věříme, že OncoMatch může výzkumníkům ušetřit čas a pomoci jim navazovat spolupráce, ke kterým by se jinak obtížně dostávali,“ dodávají autoři řešení OncoMatch.

Výběr článků

Načítám