Politikův pomocník Valerij Natarov řekl agentuře AP, že Gajdar zemřel ve středu v časných ranních hodinách při práci na své knize. Příčinou úmrtí byla podle jeho slov krevní sraženina. Podle spolupředsedy Gajdarovy strany Pravé dílo Leonida Gozmana Gajdar zemřel u sebe doma ve čtyři hodiny ráno místního času. Také on uvádí jako příčinu smrti trombózu.

Za vlády bývalého ruského prezidenta Borise Jelcina zastával Gajdar funkci ministra hospodářství a proslul tím, že zlikvidoval centrálně řízenou sovětskou ekonomiku. Od června do prosince roku 1992 byl předsedou vlády.

V listopadu roku 2006 upadl v Irsku nakrátko do bezvědomí, ale lékaři dublinské nemocnice pak oznámili, že jeho zdraví není ohroženo. Gajdar pak několikrát opakoval, že se ho někdo pokusil otrávit, ale nepřátele neoznačil.