Suharto, který vládl Indonésii 32 let, byl těžce nemocen a 4. ledna byl hospitalizován s problémy plic, srdce a ledvin. Lékařům se později podařilo zlikvidovat infekci a oznámili, že se Suharto uzdravuje.  

V neděli se jeho stav prudce zhoršil a že Suharto upadl do komatu. Zemřel asi  deset minut po 13. hodině místního času (7:10 SEČ). K jeho lůžku bylo po zprávě, že mu rychle klesá krevní tlak, povoláno několik desítek lékařů.

"Druhý indonéský prezident Hadži Muhamad Suharto zemřel ve 13:10," oznámil policejní důstojník Diky Sondani reportérům v jakartské nemocnici Pertamina.

Protesty, násilí, korupce 

Suharto odstoupil z prezidentské funkce v roce 1998 pod tlakem masových protestů v době hluboké ekonomické a sociální krize v zemi. Poté byl obžalován z korupce a zpronevěry 57l miliónů dolarů (10,1 miliardy korun), které údajně prostřednictvím charitativních nadací převedl na přátele a příbuzné.

V roce 2000 soud řízení zastavil s odůvodněním, že proces není možný kvůli jeho zdravotnímu stavu. Loni na něj podali indonéští prokurátoři civilní žalobu, v níž žádali 1,54 miliardy amerických dolarů náhrady za škody a za zpronevěru státních fondů během jeho vládnutí.

Historici odhadují, že v době Suhartova nástupu k moci v druhé polovině 60. let bylo zlikvidováno 800 000 příznivců komunismu. Indonéská armáda pak také při zásazích proti hnutím nezávislosti na Východním Timoru a v provinciích Aceh a Paua zabila na 300 000 lidí.