Bezpečnostní složky v roce 2011 při snaze potlačit povstání proti tehdejšímu prezidentovi zabily okolo 900 lidí. Egyptská prokuratura následně Mubaraka obvinila z toho, že byl jakožto nejvyšší velitel a autokrat za smrt protestujících přímo odpovědný.

V roce 2012 soud shledal 88letého Mubaraka vinným a uložil mu doživotní trest vězení. Politik, který je prakticky od svého svržení upoután na lůžko, se ale odvolal a uspěl.

V lednu roku 2016 byl rovněž Mubarak i se svými dvěma syny Alou a Gamálem pravomocně odsouzen ke třem rokům vězení za korupci. Jelikož ale strávil déle než tři roky ve vazbě ve vězeňské nemocnici, může nyní na svobodu.