Milota se vyučil filmovým laborantem a v rámci vojenské služby působil u armádního filmu. Jako kameraman spolupracoval například s Janem Procházkou, Vladimírem Sísem, Evaldem Schormem či Drahomírou Vihanovou.

Patrně nejznámějším a rovněž posledním celovečerním snímkem, u něhož stál Milota za kamerou, byl Spalovač mrtvol režiséra Juraje Herze.

V roce 1969 natáčel pohřeb Jana Palacha, který se upálil na protest proti rezignaci společnosti po okupaci vojsky armád zemí Varšavské smlouvy.

Milota byl signatářem Charty 77 a spolu s manželkou organizovali legendární bytové divadlo.

Po roce 1989 působil i jako vedoucí kanceláře sekretariátu prezidenta Václava Havla. K profesi kameramana se již kvůli částečné ztrátě zraku nevrátil.

V roce 2016 obdržel Milota Českého lva za dlouholetý umělecký přínos filmu.

Výběr kameramanské filmografie Stanislava Miloty
Spalovač mrtvol (režie Juraj Herz); 1968
Piknik (režie Vladimír Sís, Ladislav Smoček); 1967
Anděl blažené smrti (režie Štěpán Skalský); 1965
Na laně (režie Ivo Novák); 1963
Jan 69 (dokument); 1969
Zmatek 68 (dokument); 1990