Protopopov nechal rozebrat padesát kilometrů dlouhé panelové silnice v oblasti Komi na dalekém severu. Silnice byla rozebrána v letech 2014 a 2015, sedm tisíc betonových panelů vyztužených ocelovou armaturou získala stavební firma, která je pak prodala.

Podle vyšetřovatelů způsobil státu Protopopov škodu ve výši přes šest miliónů rublů (asi dva milióny korun). Kolik peněz získal on sám, není jasné. Hrozí mu trest v délce až deseti let vězení. Spolu s ním je stíhán ještě jeden úředník.

Protopopov byl od v letech 2010 až 2015 šéfem vězeňské služby v Komi, přičemž dostal medaili za vytvoření jednotného ducha.