Proces trval pět měsíců a soud vyslechl 40 svědků. Obhájcům se však podařilo zpochybnit výpovědi dvou utajených svědků. Podle obhajoby utajení svědci vůbec nebyli v době vraždy na místě činu. Všichni obžalovaní svorně tvrdili, že jsou nevinní.

Prokurátorka připustila, že v rámci přípravného řízení se nepodařilo získat nezpochybnitelný důkaz proti obviněným. Navzdory tomu žádala udělení trestu ve výši 10 až 15 let.

Tupý byl při útoku 4. listopadu 2005 bodnut celkem osmkrát do zad. Student utrpěl také vážná zranění hlavy, když ho útočníci udeřili boxerem a skočili mu na hlavu. Bezprostřední příčinou smrti bylo vnitřní krvácení.

Vražda Tupého vyvolala na Slovensku řadu protestů proti vzmáhající se aktivitě neonacistů.