Proti se stavějí zejména ochránci životního prostředí, kteří se obávají, že metro by mělo negativní dopady na místní laguny. Výstavba trati by mohla začít nejdříve v lednu 2004. V porovnání s ambiciózními plány na výstavbu pohyblivých hrází na přístupech k městu od moře, které ekologové rovněž kritizují, představuje metro jen menší projekt. Smyslem hrází je chránit město a jeho památky před stále častějšími a silnějšími záplavami. Zrovna v těchto dnech jsou Benátky opět pod vodou. Turisté se v jeho ulicích pohybují jen v holínkách či na vyvýšených dřevěných lávkách. Letošní zimu zažívá město nejvydatnější povodně ve své historii.