Sídlo scientologické církve navštěvuje až třikrát denně, uvedl deník The Sun. Holmesová byla vychována jako katolička, ale konvertovala k scientologické církvi poté, co se seznámila s Cruisem. 

Známá řekla: "Její rodina začíná mít velký strach. Nevědí, čemu je učena. Je čím dál tím více a více vzdálená, zdá se, že uctívá scientologii stejně tak, jako Cruise."