Provoz na vedlejší dráze obtěžuje hlukem obyvatele Kladna a části šesté městské části, letiště ji proto využívá jen výjimečně.

Letiště bude hlavní dráhu uzavírat a využívat vedlejší dráhu vždy mezi 7:30 a 18:30. Podle zkušeností by měla většina letadel vzlétat směrem na Kladno, konkrétní směr závisí na aktuálním směru větru, uvedlo letiště. Přistávat by pak měla letadla především ze směru od pražských Řep.

Hlavní přistávací dráha je dva roky po generální rekonstrukci, během které byl kompletně vyměněn povrch ranveje, což letiště odůvodňovalo končící životností konstrukce. To bylo spojeno i s prodlužující se délkou pravidelných jarních a podzimních údržbových prací.

Zatímco nyní je odstávka hlavní dráhy plánována na tři dny, před rekonstrukcí, která pražské letiště vyšla na 520 miliónů korun, odstávka dráhy trvala i dva týdny.