Součástí této fáze revitalizace bude vybudování nového centra, které bude sloužit jako zákaznické centrum, kde si cestující budou moci zakoupit jízdenky a získat informace o spojích. V blízkosti nového zákaznického centra také vznikne nová úschovna zavazadel. Vstup do stanice metra bude v této části nádraží zachován.

V průběhu této fáze bude vybudováno 3000 metrů čtverečních nových obchodních ploch. Ukončení je naplánováno do konce roku 2008. Revitalizace pražského hlavního nádraží bude trvat 5 let.